Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f6O54917 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms