Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms