Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vmn1r58G3X9U3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms