Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms