Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6619F6URP1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms