Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms