Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf217D3YYI7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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