Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calcoco2A2A6M5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms