Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms