Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgfrQ9Z0W1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms