Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms