Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ropn1Q9ESG2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms