Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pold3Q9EQ28 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms