Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TrmuQ9DAT5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TrmuQ9DAT5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TrmuQ9DAT5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TrmuQ9DAT5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TrmuQ9DAT5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms