Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms