Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspan11Q9D1D1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan11Q9D1D1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms