Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Chchd5Q9CQP3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Chchd5Q9CQP3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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