Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms