Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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