Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms