Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgd6Q69ZL1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms