Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5dQ62240 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5dQ62240 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5dQ62240 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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