Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpn1lQ5XFR0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpn1lQ5XFR0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpn1lQ5XFR0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpn1lQ5XFR0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms