Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Xirp2Q4U4S6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms