Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SvipQ3UZP4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms