Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc162pQ0VG85 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms