Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms