Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nme2Q01768 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms