Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pitx2P97474 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms