Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms