Protein–RNA interactions for Protein: P61750

Arf4, ADP-ribosylation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf4P61750 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf4P61750 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms