Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCAP28676 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCAP28676 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCAP28676 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCAP28676 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCAP28676 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCAP28676 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCAP28676 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCAP28676 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCAP28676 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCAP28676 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms