Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NelfeP19426 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NelfeP19426 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms