Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01791 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01791 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01791 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms