Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl20O89093 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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