Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CopeO89079 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CopeO89079 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CopeO89079 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CopeO89079 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CopeO89079 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CopeO89079 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms