Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm20877J3QPZ4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm20877J3QPZ4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20877J3QPZ4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm20877J3QPZ4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm20877J3QPZ4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm20877J3QPZ4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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