Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calhm3J3QMI4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms