Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms