Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms