Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms