Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clic1Q9Z1Q5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clic1Q9Z1Q5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Clic1Q9Z1Q5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Clic1Q9Z1Q5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clic1Q9Z1Q5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Clic1Q9Z1Q5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clic1Q9Z1Q5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Clic1Q9Z1Q5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Clic1Q9Z1Q5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clic1Q9Z1Q5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clic1Q9Z1Q5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clic1Q9Z1Q5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clic1Q9Z1Q5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clic1Q9Z1Q5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clic1Q9Z1Q5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic1Q9Z1Q5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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