Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Plod3Q9R0E1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod3Q9R0E1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms