Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf4Q9QZS2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf4Q9QZS2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Rnf4Q9QZS2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rnf4Q9QZS2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf4Q9QZS2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf4Q9QZS2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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