Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnnt3Q9QZ47 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnt3Q9QZ47 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms