Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Exo1Q9QZ11 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms