Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wdr61Q9ERF3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms