Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms