Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms