Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms